Apoenzim, kofaktörü veya koenzimi olmayan ve bu nedenle kimyasal reaksiyonu katalize edemeyen bir protein molekülüdür. Koenzimler ve kofaktörler, enzimlerin düzgün çalışması için gerekli olan protein olmayan moleküllerdir. Metal iyonları, organik moleküller veya diğer inorganik bileşikler olabilirler.
Bir apoenzim, kofaktörüne veya koenzimine bağlandığında aktif bir enzim haline gelir ve spesifik bir kimyasal reaksiyonu katalize edebilir. Kofaktör veya koenzim reaksiyona doğrudan katılabilir veya enzim yapısının stabilize edilmesine ve reaksiyonun gerçekleşmesi için uygun ortamın yaratılmasına yardımcı olabilir.
Bazı enzimler yalnızca tek bir kofaktör veya koenzime ihtiyaç duyarken, diğerleri düzgün çalışabilmek için birden fazla kofaktör veya koenzime ihtiyaç duyabilir. Kofaktörler ve koenzimler tipik olarak bir enzim reaksiyonu sırasında geri dönüştürülür, dolayısıyla stokiyometrik miktarlarda tüketilmelerine gerek yoktur.