İlk Ebola virüsü salgını 1976'da şimdiki Demokratik Kongo Cumhuriyeti'nde (eski adıyla Zaire) meydana geldi. Salgın, virüse adını veren Ebola Nehri yakınındaki bir köyde meydana geldi. İkinci salgın yine 1976'da şimdiki Güney Sudan'da meydana geldi. O zamandan bu yana Afrika'da çok sayıda Ebola virüsü salgını yaşandı.