Erkekten kadına (MTF) SRS için iyileşme süresi genellikle 6-8 hafta civarındadır. Buna ameliyat yaralarının iyileşmesi ve vücudun yeni hormonal dengeye uyum sağlaması için gereken süre de dahildir. Bu süre zarfında hastalar şişlik, rahatsızlık ve hareket kısıtlılığı yaşayabilir. Enfeksiyonu önlemek için ağrı kesici ilaç ve antibiyotik almaları da gerekebilir.
Kadından erkeğe (FTM) SRS için iyileşme süresi genellikle 4-6 hafta civarındadır. Buna ameliyat yaralarının iyileşmesi ve vücudun yeni hormonal dengeye uyum sağlaması için gereken süre de dahildir. Bu süre zarfında hastalar şişlik, rahatsızlık ve idrar yapmada zorluk yaşayabilir. Enfeksiyonu önlemek için ağrı kesici ilaç ve antibiyotik almaları da gerekebilir.
Her iki durumda da hastaların iyileşme döneminde cerrahlarının talimatlarını dikkatle takip etmeleri gerekecektir. Bu, aktivite, diyet ve cinsel aktiviteye ilişkin kısıtlamaları içerebilir. SRS ile gelen fiziksel ve duygusal değişikliklere tam olarak uyum sağlamak biraz zaman alabileceğinden, iyileşme sürecinde sabırlı ve gerçekçi olmak da önemlidir.