Sjögren sendromu ve lupus otoimmün hastalıklardır ancak aynı hastalık değildir. Lupus, cilt, eklemler, böbrekler, akciğerler ve kalp de dahil olmak üzere vücudun birçok farklı bölümünü etkileyebilen sistemik bir otoimmün hastalıktır. Sjögren sendromu öncelikle tükürük ve gözyaşı üreten ekzokrin bezleri etkileyen otoimmün bir hastalıktır.