Enfeksiyon: Kalp nakli alıcıları, almaları gereken bağışıklık sistemini baskılayıcı ilaçlar nedeniyle enfeksiyonlara karşı daha duyarlıdır. Bu enfeksiyonlar hafiften yaşamı tehdit eden boyutlara kadar değişebilir.
Koroner arter hastalığı: Kalp nakli alıcılarında, kalp yetmezliğine yol açabilecek koroner arter hastalığı gelişme riski daha yüksektir. Bu riskin nakil ameliyatı sırasında kalpte meydana gelen hasardan kaynaklandığı düşünülmektedir.
Diğer komplikasyonlar: Kalp naklinin diğer komplikasyonları kanama, kan pıhtılaşması, böbrek yetmezliği ve diyabeti içerebilir.
Kalp naklinin riskleri, işleme başlamadan önce dikkatle değerlendirilmelidir. Ancak birçok insan için kalp nakli hayatta kalmanın tek seçeneğidir.