Koch'un varsayımları şunu belirtin:
1. Hastalığın her vakasında mikroorganizmanın mevcut olması gerekir.
2. Mikroorganizma izole edilmeli ve saf kültürde yetiştirilmelidir.
3. Mikroorganizmanın saf kültürü, sağlıklı ve duyarlı bir konakçıya verildiğinde hastalığa neden olmalıdır.
4. Mikroorganizma deneysel olarak enfekte olmuş konakçıdan yeniden izole edilmelidir.
Bu varsayımlar tüberküloz, kolera ve difteri dahil olmak üzere birçok bulaşıcı hastalığın etken maddelerini tanımlamak için kullanılmıştır. Bugün tıbbi mikrobiyolojide önemli bir araç olmaya devam ediyorlar.
Koch'un önermeleri üzerine yaptığı çalışmalara ek olarak Koch, bakterileri mikroskop altında görselleştirmek için kullanılan çeşitli boyama teknikleri de geliştirdi. Ayrıca Berlin'de Bulaşıcı Hastalıklar Enstitüsü'nü kurdu ve bu enstitü daha sonra onun onuruna Robert Koch Enstitüsü olarak değiştirildi.
Koch'un çalışmasının tıp alanında derin bir etkisi oldu ve modern mikrobiyolojinin gelişiminin temellerinin atılmasına yardımcı oldu. 19. yüzyılın en etkili bilim adamlarından biri olarak kabul edilir.