Pilonidal kistler cerrahi olarak çıkarıldıktan sonra yüksek bir nüks oranına sahiptir; rapor edilen nüks oranları tıbbi literatürde büyük farklılıklar göstermekle birlikte genellikle %10 ila %30 arasında değişmektedir. Kanalın veya sinüsün tamamının tam olarak çıkarılmaması, kistin derin veya karmaşık yapısı, yara iyileşmesinin zayıf olması, enfeksiyon, obezite veya etkilenen bölgede aşırı kıllanma gibi bazı faktörler tekrarlama riskini artırabilir.