Sinüs enfeksiyonlarına genellikle burun veya boğazda bulunan bakteri veya virüsler neden olur. Sinüs enfeksiyonlarına neden olan yaygın bakteri türleri arasında Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae ve Staphylococcus aureus bulunur. Soğuk algınlığı ve grip virüsleri gibi virüsler de sinüs enfeksiyonlarına yol açabilir.