Glomerulus, kandaki üre, kreatinin ve ürik asit gibi atık ürünleri filtreler. Süzüntü ayrıca su, elektrolitler ve glikoz içerir. Bowman kapsülü, süzüntüdeki suyun, elektrolitlerin ve glikozun çoğunu yeniden emer. Artık konsantre olan kalan süzüntüye idrar denir.
İdrar, Bowman kapsüllerini toplama kanallarına bağlayan küçük tüpler olan böbrek tübüllerinden akar. Böbrek tübülleri, kalan suyun ve elektrolitlerin bir kısmını yeniden emerek ve hidrojen iyonları ve potasyum iyonları gibi diğer maddeleri idrarın içine salgılayarak idrarı daha da değiştirir.
Toplama kanalları idrarı böbrek tübüllerinden toplar ve böbrek pelvisine taşır. Renal pelvis, böbrekleri üreterlere bağlayan huni şeklinde bir yapıdır. Üreterler idrarı böbreklerden mesaneye taşır.