Bazı gıdalar ve ilaçlar gibi diğer alerjenler yutulur ve ishal, bulantı ve kusma gibi gastrointestinal semptomlara neden olur. Bu alerjenler tipik olarak alerjenlere bağlanan ve bağırsaktaki bağışıklık hücrelerinden inflamatuar aracıların salınmasını tetikleyen immünoglobulin G (IgG) veya immünoglobulin A (IgA) adı verilen antikorlar tarafından tanınır. Bu aracılar alerjik reaksiyon semptomlarına neden olur.
Bazı durumlarda alerjen hem solunum hem de gastrointestinal semptomlara neden olabilir. Bunun nedeni, bazı alerjenlerin hem solunabilmesi hem de yutulabilmesi veya farklı kaynaklardan gelen alerjenlerle çapraz reaksiyona girebilmesidir. Örneğin polene alerjisi olan bir kişinin elma ve havuç gibi bazı meyve ve sebzelere de alerjisi olabilir çünkü bu gıdalar polende bulunan proteinlere benzer proteinler içerir.