* Çoklu klonlama sitesi (MCS) :Bu bölge, ilgilendiğiniz geni plazmide yerleştirmenize izin veren bir dizi kısıtlama enzimi bölgesi içerir.
* T7 destekleyicisi :Bu promoter, MCS'nin yukarısında bulunur ve ilgilendiğiniz genin ekspresyonunu yönlendirmek için kullanılır.
* BGH poliadenilasyon sinyali :Bu sinyal, MCS'nin aşağısında bulunur ve ilgilendiğiniz genin transkripsiyonunu sonlandırmak ve mRNA'ya bir poli(A) kuyruğu eklemek için kullanılır.
* Ampisilin direnç geni :Bu gen, ampisilin antibiyotiğine direnç kazandırır ve plazmidi başarılı bir şekilde ele geçiren bakterileri seçmenize olanak tanır.
* ColE1 çoğaltma kaynağı :Bu bölge bakterilerdeki plazmitin replikasyonu için gereklidir.
* Kanamisin direnç geni :Bu gen, kanamisin antibiyotiğine direnç kazandırır ve plazmidi başarılı bir şekilde ele geçiren bakterileri seçmenize olanak tanır.
pcDNA3.1 plazmidi, memeli hücrelerinde çok çeşitli genleri ifade etmek için kullanılabilen çok yönlü bir ifade vektörüdür.