İntratekal kemoterapi, BOS'a ulaşmak için sırtın alt kısmına bir iğnenin yerleştirildiği lomber ponksiyon yoluyla uygulanır. Kemoterapi ilaçları daha sonra CNS'deki kanser hücrelerine ulaşıp onları öldürebilecekleri BOS'a enjekte edilir.
İntratekal kemoterapi, merkezi sinir sistemi kanserleri için çok etkili bir tedavi yöntemidir ancak bulantı, kusma, saç dökülmesi ve nöbetler gibi ciddi yan etkilere de neden olabilir. Bu yan etkiler genellikle geçicidir ve tedavi tamamlandıktan sonra ortadan kaybolur.
İntratekal kemoterapi tipik olarak radyasyon terapisi ve sistemik kemoterapi gibi diğer tedavilerle kombinasyon halinde kullanılır. Tedavinin amacı merkezi sinir sistemindeki tüm kanser hücrelerini öldürmek ve kanserin tekrarlamasını önlemektir.