Bakteriler:
- Streptococcus pyogenes (strep boğaz)
-Stafilokok aureus
- Streptococcus pneumoniae
- Haemophilus influenzae
- Mikoplazma pnömonisi
- Chlamydia pneumoniae
- Neisseria gonore
Virüsler:
- Grip virüsleri (grip)
- Parainfluenza virüsleri
- Solunum sinsityal virüsü (RSV)
- Adenovirüsler
- Herpes simpleks virüsü
- Epstein-Barr virüsü
- Sitomegalovirüs
Mantarlar:
- Candida albicans (pamukçuk)
Diğer mikroorganizmalar:
- Mikoplazma hominis
- Ureaplasma urealyticum
Boğaz enfeksiyonuna neden olan mikroorganizmanın türü, kişinin yaşı, bağışıklık sistemi durumu ve spesifik patojenlere maruz kalma gibi faktörlere bağlı olacaktır. Bazı mikroorganizmalar belirli coğrafi bölgelerde veya yılın belirli zamanlarında daha yaygındır.