HCPCS değiştiricileri ile CPT değiştiricileri arasındaki temel farklardan bazıları şunlardır:
1) HCPCS değiştiricileri sağlık hizmetleri ve prosedürlerine daha spesifiktir. Örneğin, "ayakta hasta bakımı" için spesifik bir HCPCS değiştiricisi mevcutken (değiştirici -22), "ayakta hasta bakımı" için karşılık gelen CPT değiştiricisi daha geneldir (değiştirici -52).
2) HCPCS değiştiricileri, CPT değiştiricileri kadar yaygın olarak kullanılmaz. CPT değiştiricileri çeşitli sağlık hizmetleri ve prosedürlerinde kullanılırken, HCPCS değiştiricileri yalnızca HCPCS'ye özel belirli sağlık hizmetleri ve prosedürlerinde kullanılır.
3) HCPCS değiştiricileri her zaman tüm ödeme yapanlar tarafından tanınmaz. Bazı ödeme yapanlar HCPCS değiştiricilerini tanımayabilir ve bu da taleplerin reddedilmesine yol açabilir. Tanınacağından emin olmak için bir HCPCS değiştiriciyi kullanmadan önce ödeme yapan kişiyle görüşmeniz önemlidir.