Bazı durumlarda omfalosel onarımı aşamalı olarak yapılabilir. Örneğin, omfalosel çok büyükse, cerrah başlangıçta defektin üzerine bir silo veya ağ yerleştirip tamamen kapatmadan önce boyutunu yavaş yavaş küçültebilir.
Omfalosel onarımının amacı karın içeriğini güvenli bir şekilde bebeğin karnına geri döndürmek ve karın duvarı defektini kapatmaktır. Ameliyat genellikle genel anestezi altında yapılır ve riskleri en aza indirmek ve başarılı bir sonuç sağlamak için özel cerrahi tekniklerin kullanılmasını gerektirebilir.