Chlamydia trachomatis enfeksiyonu için, özellikle doksisiklin tolere edilemediği veya ilaç direnci nedeniyle önerilmediği durumlarda genellikle alternatif tedavi seçeneği olarak siprofloksasin önerilmektedir. Azitromisin genellikle Chlamydia için tercih edilen birinci basamak tedavidir, ancak siprofloksasin yüksek tedavi oranlarıyla etkili bir alternatif olabilir.
Mycoplasma genitalium enfeksiyonuyla ilgili olarak siprofloksasin genellikle birinci basamak tedavi olarak kabul edilmez. Ancak çalışmalar, siprofloksasinin bazı vakalarda M. genitalium tedavisinde etkili olabileceğini öne sürüyor. Bazı kanıtlar, azitromisin ve siprofloksasin ile ikili tedavinin, tek başına antibiyotiğe kıyasla M. genitalium enfeksiyonunun tedavi sonuçlarını iyileştirebileceğini göstermektedir.
NGU'ya yönelik spesifik tedavi önerilerinin neden olan organizmaya, yerel direnç kalıplarına ve bireysel hasta faktörlerine göre değişebileceğini unutmamak önemlidir. Bu nedenle, NGU semptomları yaşayan bireylerin, doğru tanı ve uygun tedavi için bir sağlık uzmanından uygun tıbbi değerlendirmeye başvurmaları önemlidir. Uygun tıbbi tavsiye olmadan kendi kendine ilaç tedavisi, yetersiz tedaviye ve potansiyel komplikasyonlara yol açabilir.