* Maliyet: Hemşirelik bilişim sistemlerinin uygulanması, hem donanım ve yazılım maliyetleri hem de sistemleri kullanacak eğitim personelinin maliyeti açısından pahalı olabilir.
* Karmaşıklık: Hemşirelik bilişim sistemleri karmaşık ve kullanımı zor olabilir, bu da hatalara ve hayal kırıklıklarına yol açabilir.
* Veri gizliliği ve güvenliği: Hemşirelik bilişim sistemleri, yetkisiz erişim ve kullanıma karşı korunması gereken büyük miktarda hassas hasta verisini depolar.
* İş akışı kesintisi: Hemşirelik bilişim sistemlerinin uygulanması, mevcut iş akışlarını ve süreçleri bozabilir, bu da üretkenliğin ve verimliliğin azalmasına neden olabilir.
* Standartlaştırma eksikliği: Hemşirelik bilişim sistemlerinde standardizasyon eksikliği, farklı sistemler arasında veri paylaşımını zorlaştırabilmektedir.
* Değişime direnç: Bazı hemşireler değişime dirençli olabilir ve yeni hemşirelik bilişim sistemlerini benimsemeye istekli olmayabilir.