Medulla oblongata ve pons: Beyin sapının bu bölgeleri nefes almanın hızını ve derinliğini otomatik olarak kontrol eder. Diyaframa ve kaburgalar arasındaki kaslara sinyaller göndererek kasılma ve gevşemelerini kontrol ederek havanın akciğerlere girip çıkmasını sağlarlar.
Geri bildirim mekanizmaları: Solunum sistemi kandaki karbondioksit ve oksijen seviyesindeki değişiklikleri tespit edebilir ve solunum hızını buna göre ayarlayabilir. Bu nedenle nefes alma, bilinçli düşünceye gerek kalmadan vücudun gaz alışverişi taleplerine yanıt verir.
Ancak şunu da unutmamak gerekir ki nefes alma bir dereceye kadar istemli olarak kontrol edilebilir. Örneğin egzersiz sırasında nefesinizi kısa bir süre tutabilir veya daha derin nefes alabilirsiniz. Bununla birlikte, nefes almanın temel ritmi istemsiz kalır ve vücudun sürekli olarak ihtiyaç duyduğu oksijeni almasını ve karbondioksiti ortadan kaldırmasını sağlar.