Hem frengi hem de Lyme hastalığına bakteriler neden olur. Frengiye Treponema pallidum neden olur, Lyme hastalığına ise Borrelia bakteri türleri neden olur. Ayrıca frengi ve Lyme hastalığının her ikisinin de farklı semptomları olan birkaç aşaması vardır.