Tipik bir babalık DNA testinde çocuğun, annenin ve baba olduğu iddia edilen kişinin DNA profilleri, iddia edilen babanın çocuğun biyolojik babası olup olmadığını belirlemek için karşılaştırılır. Eğer iddia edilen baba gerçekten biyolojik babaysa, DNA profili, test edilen tüm genetik belirteçlerde çocuğun DNA profiliyle eşleşecektir. Ancak anne ve iddia edilen babanın akraba olması durumunda, aynı genetik belirteçlerden bazılarını paylaşabilirler ve bu da DNA sonuçlarının yorumlanmasında belirsizliklere yol açabilir.
Bu sorunu çözmek için babalık DNA test laboratuvarları babalık olasılığını hesaplamak için istatistiksel yöntemler kullanır. Bu yöntemler, anne ile baba olduğu iddia edilen kişinin çocuğun biyolojik babası olma olasılığını belirlemek için anne ile baba olduğu iddia edilen arasındaki genetik benzerlikleri dikkate alır. Babalık ihtimali yeterince yüksekse, iddia edilen babanın biyolojik baba olduğu yüksek derecede kesin olarak belirlenebilir.
Ancak anne ile baba olduğu iddia edilenin kardeş veya ebeveyn-çocuk gibi yakın akraba olduğu durumlarda, tek başına DNA testiyle babalığın kesin olarak belirlenmesi mümkün olmayabilir. Bu vakalarda babalığın tespiti için tıbbi kayıtlar veya tanık ifadeleri gibi ek deliller gerekli olabilir.
Babalık DNA testi laboratuvarlarının, anne ile baba olduğu iddia edilen kişi arasında akrabalık olması durumunda olası yanlışlıkların farkında olduklarını ve yanlış yorumlama riskini en aza indirecek adımlar attıklarını belirtmek önemlidir. Babalık DNA testinin sonuçları hakkında herhangi bir şüphe varsa, sonuçların doğruluğunu sağlamak için ek testler veya analizler yapılabilir.