Filtre iğneleri tek kullanımlık ürünlerdir ve her kullanımdan sonra atılmalıdır. Filtre iğnelerinin tekrar kullanılması kirletici maddelerin bulaşmasına neden olabilir ve enfeksiyon veya numunenin çapraz kontaminasyonu riskini artırabilir. Ayrıca iğnelerin tekrar kullanılması filtreye zarar verebilir ve filtreleme işleminin doğruluğunu etkileyebilir. Bu nedenlerden dolayı her filtreleme işleminde daima yeni bir filtre iğnesi kullanılması önemlidir.