* Kanama: Transsfenoidal cerrahi burun, ağız veya boğazda kanamaya neden olabilir. Nadir durumlarda kanama şiddetli olabilir ve kan nakli gerektirebilir.
* Enfeksiyon: Ameliyat bölgesi enfeksiyon kapabilir ve ateş, titreme ve ağrıya neden olabilir. Nadir durumlarda enfeksiyon beyne veya vücudun diğer bölgelerine yayılabilir.
* Beyin omurilik sıvısı (BOS) sızıntısı: BOS beyni ve omuriliği yıkayan sıvıdır. Ameliyat sırasında beyni ve omuriliği kaplayan sert zar olan dura mater yırtılırsa BOS sızıntısı meydana gelebilir. BOS sızıntısı baş ağrısına, mide bulantısına ve kusmaya yol açabilir. Nadir durumlarda, BOS sızıntısı yaşamı tehdit edici olabilir.
* Hipofiz bezinde hasar: Hipofiz bezi kafatasının tabanında bulunan küçük bir bezdir. Hipofiz bezi büyüme, metabolizma ve üreme dahil olmak üzere çeşitli vücut fonksiyonlarını kontrol eden hormonlar üretir. Hipofiz bezinin hasar görmesi çeşitli hormon eksikliklerine yol açabilir.
* Görme sinirlerinde hasar: Optik sinirler görsel bilgiyi gözden beyne taşıyan sinirlerdir. Optik sinirlerin hasar görmesi görme kaybına neden olabilir.
* Kontur: Ameliyat sırasında beyne giden kan akışı kesilirse felç meydana gelebilir. Felç, zayıflık, uyuşukluk ve konuşma güçlüğü gibi çeşitli semptomlara neden olabilir.
* Ölüm: Nadir durumlarda transsfenoidal cerrahi ölümcül olabilir. Kalp hastalığı, akciğer hastalığı veya diyabet gibi diğer tıbbi rahatsızlıkları olan hastalarda ölüm riski artar.
Transsfenoidal cerrahinin riskleri, prosedürün uygulanıp uygulanmayacağına karar vermeden önce cerrahinin yararlarına karşı dikkatli bir şekilde tartılmalıdır.