Yayılan sinyalin gücü dokudaki protonların yoğunluğuna bağlıdır. Bu, MRI'nın farklı dokulardaki protonların dağılımına dayalı olarak vücudun görüntülerini oluşturmasına olanak tanır. Örneğin kan ve beyin omurilik sıvısı gibi sudan zengin dokular MR görüntülerinde parlak görünürken, kemik ve kas gibi yağdan zengin dokular koyu görünür.
MRI, vücuttaki çok çeşitli doku ve organları incelemek için kullanılabilen çok yönlü bir görüntüleme tekniğidir. Özellikle beyin, kalp ve böbrekler gibi yumuşak dokuların görüntülenmesinde faydalıdır. MR ayrıca kanser, felç ve kalp hastalığı dahil çeşitli tıbbi durumların teşhis edilmesi ve izlenmesi için de kullanılır.